Supporting materials
Download
Download this article as a PDF
Превод Ралица Алексова. През 1953, Джеймс Уотсън и Франсис Крик установиха структурата на ДНК, молекулата, която носи нашата генетична информация.
През 1958 г. Крик представи централната догма на молекулярната биология, че информационният поток тече от ДНК към РНК към белтъците. Но остана въпросът: как азбуката от четири букви-нуклеотиди на ДНК (А, Ц, Т и Г) или техният еквивалент в РНК (А, Ц, У и Г) кодират 20-те букви в азбуката на аминокиселините, от които са изградени нашите белтъци? Какъв е генетичният код?
През 1961 г., Маршъл У Ниренбърг и Йохан Х Матеи разшифрираха първата буква от кода разкривайки, че РНК секвенцията УУУ (UUU) кодира аминокиселината фенилаланин. В последствие, Хар Гобинд Хорана показа че повтарящата се секвенция нуклеотиди UCUCUCUCUCUC кодира нишка от аминокиселини отговаряща на серин-люцин-серин-люцин. През 1965 г., основно благодарение на работата на Ниренбърг и Хорана генетичният код бе напълно разрешен. Беше разкрито, че всяка група от три нуклеотида (наречена кодон) кодира за специфична аминокиселина и редът на кодоните определя реда на аминокиселините (и оттам химичните и биологични свойства) на съответния белтък.
Ниренбърг и Хорана сравниха къси секвенции на нуклеотидната киселина РНК и производните им секвенции от аминокиселини (пептиди). За да постигнат това, те следваха протокол разработен от Ниренбърг заедно с Матеи.
Това включва изкуствения синтез на специфична секвенция от РНК нуклеотиди и смесването ѝ с екстракти от бактерията Ешерихия коли, които съдържат рибозоми и други клетъчни елементи необходими за белтъчния синтез. След това учените приготвиха 20 проби от тази смес; към всяка проба добавиха по една радиоактивна аминокиселина и 19 обикновени аминокиселини и оставиха белтъчния синтез да протече. Всяка от 20-те проби съдържа различна радиоактивна аминокиселина. Ако получилият се пептид е радиоактивен, това означава, че радиоактивната аминокиселина е била включена и потвърждава, че някоя част от секвенцията РНК нуклеотиди кодира тази аминокиселина.
Повторни експерименти с различни РНК секвенции позволяват да се събере още и още информация за генетичния код. След като били тествани прости секвенции като UUUUUU и AAAAAA, други групи от учени се включиха в предизвикателството, анализирайки по-сложни РНК секвенции, в крайна сметка всички 64 кодона бяха разкодирани.
Самият генетичен код е ключов елемент от уроците по биология, и дава молекулярно обяснение за действието на гените (например за мутации, еволюция, и експресия). В допълнение, начинът, по който Ниренбърг и Хорана са разбили генетичния код – чрез сравняване на кратки секвенции РНК с получените секвенции аминокиселини – може да бъде повторен в училище като учебно занимание базирано на изследователски подход. Като използват секвенциите подадени от учителя, учениците работят в групи:
Така това занимание предлага модел за преподаването на същността на научното знание: предварителен консенсус направен от общността със заключения с различна сила базирани на частични доказателства.
Това занимание е подходящо за 14-18 годишни ученици в групи от 3-4 човека, и отнема близо 2 часа, разделени на 4 стъпки и допълнително обсъждане в края. То е замислено като въведение в молекулярната биология, преди да обясните какво е генетичния код и централната догма на молекулярната биология.
От учениците се иска да разбият код направен от различни секвенции от букви (A, C, T, G) като използват съобщенията, които тези секвенции кодират (например AspHisTrp…). Във всяка от първите три стъпки, на всеки отбор е даден различен комплект от буквени секвенции и съответните съобщения. При всяка стъпка трябва да преосмислят заключенията си от предните стъпки и да модифицират решението на кода.
Обяснете, че всички групи ще работят над разбиването на един и същи код като използват различни примери. Не издавайте на учениците си, че секвенциите са биологични (ДНК и аминокиселини); те трябва да се фокусират да намерят повтарящи се елементи и взаимоотношения.
Ниренбърг и Хорана използваха РНК секвенции, за да разбият кода; в сравнение, това занимание използва ДНК секвенции (кодони, 5¢ до 3¢). Смисълът на това занимание е съществуването на кода, а не детайлите по транскрипция и транслация, които ще бъдат покрити в следващи уроци.
След всяка стъпка може да помолите по един ученик от всеки отбор да смени групата си. (Това имитира динамиката на това как се добива и споделя научното знание, например на конференции или чрез публикации).
Иначе, учениците могат да разменят информация само когато им кажете, че могат да го направят. (Ако някоя група се затрудни или разочарова, може да е по-мотивиращо да им помогне друг отбор, а не учителя).
Дайте на учениците поне 10-15 минути да обсъдят всяка стъпка. Когато всички групи смятат, че са намерили възможно най-пълната информация за техните секвенции, преминете на следващата стъпка.
Секвенция | Съобщение | Учениците откриват, че… |
---|---|---|
ATGTTAGGTAGTAAAGATGCT | MetLeuGlySerLysAspAla | Кодът е основан на триплети и всеки триплет е един от трибуквените елементи, например Met. |
ATGCATGAAGCTATTTATGAT | MetHisGluAlaIleTyrAsp | |
ATGGGTAGTGATGAAGCTTAT | MetGlySerAspGluAlaTyr |
Секвенция | Съобщение | Учениците откриват, че… |
---|---|---|
ATGGTTTCGTACACTGCGTCA | MetValSerTyrThrAlaSer | Някои елементи могат да бъдат кодирани от повече от един триплет, например Ser. |
ATGCCGTACACATGTGTCACA | MetProTyrThrCysValThr | |
ATGACGAGTGCGTTGTGCGAT | MetThrSerAlaLeuCysAsp |
Секвенция | Съобщение | Учениците откриват, че… |
---|---|---|
TGTCATGCATCCGTCATCACTGAC | – | Триплетът ATG определя старта на съобщението, а триплета TGA определя края. |
TGCGTGACTATGGACACAGTCGT | MetAspThrVal | |
ATGTGTCGATGACTGATCATG | MetCysArg | |
ATGTGCGTACACATTTGAGTC | MetCysValHisIle | |
ATGCTGTACACATGATGCACAGT | MetLeuTyrThr |
Помолете учениците да помислят над следните въпроси:
След обсъждането, обяснете на учениците си, че секвенциите са ДНК и аминокиселини, и току-що са повторили ключов експеримент в молекулярната биология. Това би трябвало да мотивира вашите ученици да научат повече за генетичния код и централната догма на молекулярната биология, включително колко сходно е било тяхното занимание с начина по който е бил разбит генетичния код наистина.
Можете да преговорите заниманието и да напомните на учениците си какво са открили сами:
(Забележете, че заниманието би могло да доведе до нерадозумение, че протеините обикновено са направени от 6 или 7 аминокиселини, тъй че може да се наложи допълнително обяснение на това).
Обяснете, че начина, по който учениците работиха в колаборация и/ или състезание с отбори като се променят и участниците в отбора, и споделянето на информация с други отбори, наподобява начина, по който учените работят наистина.
За да улесните заниманието можете да дадете повече секвенции на учениците за всяка стъпка (например секвенциите за две групи). Също така можете да пропуснете стъпка 3 и просто да обясните ролята на старт и стоп кодоните след заниманието.
Педагогическите размисли върху заниманието описано в тази статия са част от работата на изследователската група върху езика и контекста в образованието по науките (llenguatge i contextos en educació científica, LICEC) в Автономния Университет в Барселона reference 2014SGR1492), финансирано от Испанското Министерство за Икономика и Конкурентоспособност (reference EDU2015-66643-C2-1-P).
w1 – На уебсайта на Нобеловите награди има таблица за превод на кодоните в аминокиселини: www.nobelprize.org или използвайте директната връзка: http://tinyurl.com/jkqz9vz
Статията предлага стратегия, която помага на учителите да разгледат по лесен и достъпен начин един от най-трудните аспекти в преподаването на науки: да помогнат на учениците си да разберат и оценят как всъщност работи науката. Добиването на ново знание изисква от учените да задават подходящи въпроси, да измислят и изпълняват добри експерименти, да работят заедно за да разгледат несигурните неща. Точно това трябва да направят учениците в това занимание за да разчупят генетичния код.
Очаквам, че учители по други предмети освен биология (особено математика и химия) също ще намерят статията за полезна. Ще бъде и много добро занимание за панаир на науката.
Бетина Лопес, Португалия
Download this article as a PDF